Поиск
Авторы нового исследования предложили определять животных по ДНК из воздуха
Авторы нового исследования предложили определять животных по ДНК из воздуха

Авторы нового исследования предложили определять животных по ДНК из воздуха

Элизабет Клэр и её коллеги из Лондонского университета королевы Марии, работающего в Великобритании, предположили, что сбор проб воздуха может стать быстрым и недорогим способом определения видового состава экосистем, поскольку в воздухе может содержаться достаточное количество ДНК животных для определения многих видов.

Около десяти лет назад исследователи начали анализировать следы ДНК в водоёмах, чтобы идентифицировать обитающие в них организмы. Пробы так называемой средовой ДНК (environmental DNA, eDNA) из воды озёр, ручьёв и морей позволил отслеживать инвазивные виды, а также обнаруживать редкие организмы. Совсем недавно некоторые учёные стали определять насекомых по eDNA на листьях, а также обнаружили eDNA млекопитающих в почве.

Исследования eDNA животных в воздушной среде до сих пор проводились редко. Остаётся неизвестным, насколько долго в воздухе сохраняются клетки животных. В некоторых более ранних исследованиях метагеномное секвенирование применялось для обнаружения в воздухе микроорганизмов, таких как бактерии и грибы. В 2015 году в Вашингтоне в воздушных пробах была выявлена ДНК ряда видов позвоночных и членистоногих.

Ранее в этом году Элизабет Клэр из Йоркского университета опубликовала в электронном научном журнале PeerJ исследование, согласно которому ДНК голого землекопа можно обнаружить в пробах воздуха, взятых в лаборатории.

Теперь, чтобы выяснить, можно ли обнаружить ДНК животных на открытом воздухе, Клэр и её коллеги провели эксперименты в зоопарке, где список обитающих животных известен заранее. В декабре 2020 года они установили вакуумные насосы с фильтрами в 20 точках в зоопарке города Хамертон и включили каждый из них на 30 минут.

Всего они собрали 72 пробы воздуха как снаружи, так и внутри зоопарка. После секвенирования средовой ДНК её фрагменты сопоставили с известными генетическими последовательностями.

В итоге удалось определить 17 видов животных, обитающих в зоопарке, а также тех, что живут рядом с ним — ежей и оленей. ДНК некоторых животных зоопарка была обнаружена почти в 300 метрах от вольеров. Кроме того, удалось отследить ДНК из мяса кур, свиней, коров и лошадей, которым кормили обитателей зоопарка.

Ранее с помощью секвенирования удалось изучить распространённость генов устойчивости к антибиотикам в образцах кала обезьян, людей и домашних животных

Источник: sciencemag.org